Nakon devet meseci provedenih u majčinoj utrobi, bebe po rođenju započinju sopstveni proces rasta koji uključuje formiranje mikrobioma u crevima. Bebe rođene carskim rezom imaju manje početno izlaganje korisnim bakterijama nego one rođene vaginalno, što može uticati na njihovo zdravlje. Međutim, istraživanje pokazuje da dojenje može nadoknaditi nedostatak mikroba kod beba rođenih carskim rezom. Preporučuje se što je moguće više fizičkog kontakta s bebom kako bi se razvio zdrav mikrobiom.